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基于纳米孔测序,病原微生物检测,与进化分析平台上线

时间:2021-1-25 16:19:52来源:本站原创作者:佚名点击:

中国的科学技术研究,现在正在飞速发展,对新型冠状病毒的研究更加令人呕心沥血。数据中心与中国科学院上海巴斯德研究所邓沛研究员、波兰华沙理工大学人工智能系主任诺瓦克教授等专家共同开发,基于纳米孔测量序列的病原微生物检测和进化分析平台,最近更新了在线。

该平台是数据中心去年2月推出的二代测序数据病毒基因组鉴定在线服务升级版,可检测出包括新冠病毒、SARS、流感在内的所有人类都知道基因组的病毒,疫情流行期间全国医疗机构、医生和医学研究者在线免费开放。

基因组序列是新型冠状病毒疑似病例确诊的病原学证据之一,国家卫生委员会解读新型冠状病毒感染的肺炎诊疗方案(试行第5版)时,特别是对诊断提到仅凭临床表现、胸部影像学难以识别,需要根据病原学的检查来区别。

正确的病毒基因检测,无论是新的冠状病毒在世界流行初期,还是现在的新的冠状病毒出现变异毒株,更快更正确的基因组的检测顺序结果,都是与时间竞争、及时诊疗的重要依据。

上海科技创新资源数据中心副社长李敏说:下一代纳米孔测量序列的病原微生物测量和分析流程从开始测量序列到获得测量结果的时间在1小时以内被压缩。与传统的体外培养法和荧光PCR法相比,与前两代病毒基因组的鉴定和核酸检查相比,新型基因序列在临床病原微生物检查中范围广,精度高,纳米孔序列的仪器具有便携性强、价格低、序列速度快等优点,可在不同级别的医院使用。

此外,数据中心基于遗传进化树开发进化分析模块,发现新病毒、鉴定传播链、发现超级传播者、指导药物方案等功能。

据悉,由于三代测序的门槛降低,数据中心正计划将三代排序分析平台下沉到社区医院等基层医疗机构,通过统一的在线平台提供分析服务,数据中心从排序数据接口到在线分析平台提供一致服务,各相关机构也可以自己完成排序后,将数据上传到平台进行在线分析

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